中國科學(xué)院水生生物研究所（以下簡稱水生所）是國內(nèi)唯一從事內(nèi)陸水體生命過程、生態(tài)環(huán)境保護(hù)與生物資源利用研究的綜合性學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)，其前身是1930年1月在南京成立的國立中央研究院自然歷史博物館，1934年7月改組為中央研究院動(dòng)植物研究所，1944年5月又分建成動(dòng)物研究所和植物研究所。中國科學(xué)院成立后，于1950年2月將原中央研究院動(dòng)物所、北平研究院動(dòng)物學(xué)研究所、原中央研究院植物研究所藻類部門合并，組建水生所，所址上海。1954年9月遷至武漢。2001年進(jìn)入院知識(shí)創(chuàng)新工程試點(diǎn)序列。2011年整體進(jìn)入院“創(chuàng)新2020”試點(diǎn)工程。2015年率先進(jìn)入特色研究所，2018年通過驗(yàn)收，正式進(jìn)入運(yùn)行階段。

水生所戰(zhàn)略定位和發(fā)展目標(biāo)是，面向國家在水生態(tài)環(huán)境保護(hù)、水生生物資源利用等方面的重大戰(zhàn)略需求，開展基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性重大科技問題，著力重大理論創(chuàng)新和核心技術(shù)突破。在淡水生態(tài)環(huán)境保護(hù)、水生生物多樣性形成與適應(yīng)性演化機(jī)制、水生生物資源保護(hù)、魚類基礎(chǔ)生物學(xué)和遺傳育種理論、淡水漁業(yè)模式和微藻生物技術(shù)等領(lǐng)域繼續(xù)發(fā)揮引領(lǐng)作用。

水生所先后擁有15位中國科學(xué)院院士。全所現(xiàn)有在職職工343人，其中科技人員306人，中國科學(xué)院院士5人，發(fā)展中國家科學(xué)院院士3人，研究員及正高職稱人員88人，副研究員及副高職稱人員108人。

目前水生所設(shè)有水生生物多樣性與資源保護(hù)研究中心、淡水生態(tài)學(xué)研究中心、魚類生物學(xué)及漁業(yè)生物技術(shù)研究中心、水環(huán)境工程研究中心、水生生物分子與細(xì)胞生物學(xué)研究中心和藻類生物學(xué)及應(yīng)用研究中心等6個(gè)研究中心；擁有淡水生態(tài)與生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（重組中）、國家淡水漁業(yè)工程技術(shù)研究中心、國家水生生物種質(zhì)資源庫、湖泊水污染治理與生態(tài)修復(fù)技術(shù)國家工程實(shí)驗(yàn)室等4個(gè)國家級(jí)平臺(tái)；擁有農(nóng)業(yè)部淡水養(yǎng)殖病害防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、院藻類生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)部鯽魚遺傳育種中心、湖北省水體生態(tài)工程技術(shù)研究中心、湖北省稻田綜合養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心、湖北省水生植物資源與利用工程技術(shù)研究中心、湖北省水產(chǎn)動(dòng)物營養(yǎng)與飼料工程技術(shù)研究中心、湖北省淡水漁業(yè)技術(shù)創(chuàng)新中心等8個(gè)省部級(jí)實(shí)驗(yàn)室及研究中心；擁有湖北東湖湖泊生態(tài)系統(tǒng)國家野外科學(xué)觀測研究站、三峽水庫香溪河生態(tài)系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)站、中國科學(xué)院長江上游珍稀特有魚類保護(hù)及赤水河河流生態(tài)觀測試驗(yàn)站、青海湖高原湖泊濕地生態(tài)環(huán)境科學(xué)觀測站等4個(gè)野外臺(tái)站；擁有亞洲最大的淡水魚類博物館和淡水藻種庫，世界上唯一以鯨類動(dòng)物保護(hù)和研究為目的的水族館-白鱀豚館，及分析測試中心平臺(tái)、水生生物數(shù)據(jù)分析管理平臺(tái)。

水生所自成立以來共有200項(xiàng)成果獲得獎(jiǎng)勵(lì)，出版著作165部，發(fā)表論文8301篇。近年來，本所科學(xué)家領(lǐng)銜主持了一大批包括國家重大科技專項(xiàng)、國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國家基礎(chǔ)性專項(xiàng)、國家自然科學(xué)基金、中科院先導(dǎo)專項(xiàng)、地方及大型企業(yè)等各類項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)支持，形成一批在理論上有重大突破或在應(yīng)用上有廣闊前景的研究成果。近5年來，我所發(fā)表論文2183篇，其中SCI收錄1385篇。申請(qǐng)專利204項(xiàng)，獲得授權(quán)107項(xiàng)，出版著作11部，獲得省部級(jí)以上獎(jiǎng)勵(lì)6項(xiàng)，桂建芳院士獲得2015年湖北省科學(xué)技術(shù)突出貢獻(xiàn)獎(jiǎng)。一些重要技術(shù)創(chuàng)新或技術(shù)集成獲得成功并在應(yīng)用中日臻成熟，對(duì)于我國水環(huán)境保護(hù)和漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展起到了顯著的推動(dòng)作用。這些科研產(chǎn)出，在魚類分子系統(tǒng)發(fā)育和進(jìn)化、藻類生物學(xué)研究、魚類遺傳育種學(xué)、淡水生態(tài)學(xué)、水環(huán)境工程學(xué)和保護(hù)生物學(xué)等方面回答了一系列前沿科學(xué)問題，滿足了國家在水污染治理和發(fā)展生態(tài)漁業(yè)方面的重大需求，取得了重大經(jīng)濟(jì)效益，產(chǎn)生了廣泛的社會(huì)影響。

水生所注重發(fā)揮水生生物學(xué)科技“國家隊(duì)”的作用，積極促進(jìn)地方科技事業(yè)，參與地方經(jīng)濟(jì)建設(shè)，取得了一系列成績。以國家淡水漁業(yè)工程技術(shù)研究中心（武漢）、農(nóng)業(yè)部鯽魚遺傳育種中心為依托，促進(jìn)了漁業(yè)模式和環(huán)保飼料等成果轉(zhuǎn)化，指導(dǎo)建設(shè)了一大批國家級(jí)和省級(jí)的水產(chǎn)原良種場。以湖北省和武漢市水環(huán)境工程技術(shù)研究中心為依托，推動(dòng)了我所一批水環(huán)境治理方面的核心技術(shù)向全國輻射和轉(zhuǎn)化。主持培育的高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)鳙新品種“中科佳鳙1號(hào)”、合作培育的全雌翹嘴鱖新品種“武農(nóng)1號(hào)” 和全雄雜交鱧“雄鱧1號(hào)”均獲2022年全國水產(chǎn)原種和良種審定委員會(huì)認(rèn)證的水產(chǎn)新品種。

水生所對(duì)外合作與交流活動(dòng)頻繁。近10年來，先后派出科技人員近800人次到近30個(gè)國家和地區(qū)進(jìn)行合作研究、進(jìn)修或短期訪問，同時(shí)接待了來自近40個(gè)國家和地區(qū)的專家2200多人次進(jìn)行學(xué)術(shù)交流、合作或進(jìn)修。研究所作為核心成員加入大的國際合作研究計(jì)劃，如美國的“Tree of Life”研究計(jì)劃，還發(fā)起和引領(lǐng)多邊國際合作，如淡水豚類聯(lián)合調(diào)查項(xiàng)目、主辦“水環(huán)境保護(hù)與水污染治理”國際培訓(xùn)班，“海峽兩岸人工濕地研討會(huì)”、“第十屆世界華人魚蝦營養(yǎng)學(xué)術(shù)研討會(huì)”、“第七屆亞太藻類論壇”等。

2022年11月5日至13日，《濕地公約》第十四屆締約方大會(huì)（COP14）在中國武漢開幕。期間，由武漢市園林和林業(yè)局主辦、水生所等承辦的COP14東道國系列活動(dòng)之——“共建生命長江，傳承大河文明”主題邊會(huì)于8日召開。作為COP14最大的邊會(huì)，與會(huì)專家共同交流和討論長江大保護(hù)的研究與保護(hù)進(jìn)展，分享經(jīng)驗(yàn)做法，講述國際大河流域水生生物資源保護(hù)的中國故事。會(huì)議還發(fā)布了由長江“十年禁漁”首倡者、中國科學(xué)院院士曹文宣領(lǐng)銜的“全民參與長江大保護(hù)”倡議書。

水生所是國務(wù)院學(xué)位委員會(huì)批準(zhǔn)的首批博士、碩士學(xué)位授予權(quán)單位，設(shè)有水生生物學(xué)、遺傳學(xué)、環(huán)境科學(xué)、水產(chǎn)養(yǎng)殖學(xué)、海洋生物學(xué)等5個(gè)二級(jí)學(xué)科博士研究生培養(yǎng)點(diǎn)；動(dòng)物學(xué)、水生生物學(xué)、遺傳學(xué)、環(huán)境科學(xué)、環(huán)境工程學(xué)、水產(chǎn)養(yǎng)殖等6個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士研究生培養(yǎng)點(diǎn)；生物與醫(yī)藥、資源與環(huán)境2個(gè)工程碩士研究生培養(yǎng)點(diǎn)；設(shè)有生物學(xué)、環(huán)境科學(xué)與工程、水產(chǎn)學(xué)3個(gè)專業(yè)博士后流動(dòng)站。在學(xué)研究生569人（碩士生263人，博士生311人），在站博士后97人。

主辦的中文核心、中國科技核心期刊《水生生物學(xué)報(bào)》連續(xù)被評(píng)為中國精品科技期刊、湖北省優(yōu)秀期刊，入選《中國學(xué)術(shù)期刊影響因子年報(bào)》Q1區(qū)期刊。2022年由雙月刊改為月刊，開設(shè)“十年禁漁”、“人工濕地”等特色專欄。Water Biology and Security創(chuàng)刊，季刊，被DOAJ、Scopus等數(shù)據(jù)庫收錄，入選2022年度中國科技期刊卓越行動(dòng)計(jì)劃高起點(diǎn)新刊項(xiàng)目。